阿苏是肥后内陆的巨大火山地区，广阔的破火山口外轮山环绕着有人居住的盆地。阿苏神社的祭祀与对火山及火口的崇敬相结合。世袭神职的阿苏氏也成为地方武士和领主，在镰仓、南北朝时代达到势力鼎盛。神社的土地和祭祀权，使这里既是宗教中心，也是政治中心。