云库尔位于雅库特西南部勒拿河左岸，靠近厄廖克明斯克。大河在此流经宽阔河谷，接纳来自南方的厄廖克马河，继续向东北流往雅库特中部。森林河岸与河道塑造周围景观。勒拿河在漫长冬季冰封，短暂夏季重新开放，水流连接沿谷聚落。