雅木斯克位于雅马河口，河口湾由一道沙嘴与雅姆湾分隔。雅姆湾通向鄂霍次克海东北端的舍利霍夫湾。雅马河从迈曼津山地流下，穿过内陆，抵达这片海岸水域。十七世纪，俄罗斯探险者在雅马河地区设立越冬据点；后来的雅木斯克堡则建于1739年。