西科罗拉多斯群岛沿古巴西北岸分布，向瓜纳阿卡维韦斯半岛与圣安东尼奥角伸展。低矮礁岛、浅水道和珊瑚礁在海岸与墨西哥湾之间形成屏障。半岛外是尤卡坦海峡，加勒比海水从这里进入墨西哥湾。岛屿与礁石标示古巴陆架边缘，也临近重要的海上通道。