乌斯季涅拉位于涅拉河河口，河水在此从右岸注入因迪吉尔卡河。涅拉河由杰良基尔河与胡贾赫河汇合而成，汇集东面山地的流水。因迪吉尔卡河随后向北切穿西伯利亚东北部的山脉，踏上流往北冰洋的漫长旅程。交汇处所在的地区河谷崎岖，冬季极为寒冷。