乌斯特库伊加位于亚纳河下游。这条大河从西伯利亚东北部高地向北流入拉普捷夫海。离开山地后，亚纳河进入广阔低地，在湖泊和苔原之间蜿蜒，最后抵达三角洲。漫长的北极冬季里河面冰封，短暂的开河期则使人们能够沿河谷往来。