图皮拉马位于托坎廷斯河左岸，与索努河口隔河相望。宽阔的托坎廷斯河穿过巴西中部，向亚马逊流去，两岸有林木和开阔地。后来聚落在此形成之前，原住民族已居住在托坎廷斯河流域，河上交通将广阔森林与稀树草原中的各个社区联系起来。