托莫特位于阿尔丹河流经的森林地带。阿尔丹河是勒拿河的一条大支流，从山地源头向北蜿蜒穿过雅库特南部高地，沿途汇入众多较小河流。河谷为穿越周围丘陵提供通道，但河水一年中很长时间处于冰封状态，寒冷季节也给行旅带来自己的限制。