舒伊斯科耶位于苏霍纳河右岸，介于舒亚河和谢伊布赫塔河的河口之间。地名取自舒亚河；河名被追溯至芬兰-乌戈尔语中表示沼泽和溪流的词语。苏霍纳河从库别纳湖向东流向北德维纳河，林木覆盖的河岸间分布着这条北方水道上的古老聚落。