舍姆基亚位于苏丹北部干旱地带的尼罗河畔。河流在这里绕过巴尤达沙漠，形成巨大的弯曲；聚落分布在水边狭长的土地上，另一侧便是沙漠。这一段尼罗河受到险滩阻隔，旅客也可沿当地人熟悉的路线横穿沙漠，缩短不同河湾之间的路程。