谢贝利河从埃塞俄比亚高地流向索马里印度洋海岸，随后转向西南，沿岸后方流淌。多数年份，河水在朱巴河附近的内陆消散，只有特别猛烈的洪水才能使它汇入更大的河流。沿海沙丘将下游大部分河道与大海隔开，肥沃河谷则在较干燥地区支持聚落。