圣安娜岛位于亚马孙河口，面对北岸，靠近通向上游的深水道。岛屿的位置使其周围水域受到争夺河口控制权的欧洲势力关注。十七世纪初，英国人在岛对岸设有堡垒；十八世纪，岛上发展出一处聚落。宽阔的潮汐水域环绕着森林覆盖的岛岸。