波尼尔河发源于北乌拉尔以东的森林，蜿蜒流向洛兹瓦河，从左岸汇入。上游主要向南，随后转向西；下游河道曲折，穿过散布旧河湾与湖泊的沼泽地。洛兹瓦河将其水带入塔夫达河，再流向托博尔河，属于广阔的鄂毕河流域。森林和湿地占据着这条漫长而人烟稀少的河谷。