涅姆库琴属于谢连尼亚赫山脉东北部的山地，其中一道山岭得名于流经山旁的同名河流。更广阔的谢连尼亚赫山地横亘在多个北极河流流域之间，包括因迪吉尔卡河和琼东河流域。陡峭的山脊与河谷构成西伯利亚东北部长大山地的一部分，距拉普捷夫海岸遥远。