涅尔格谢河发源于上扬斯克山脉，穿过亚纳高地，从左岸汇入阿德恰河。漫长河道沿途接纳众多支流，包括纳利亚奇亚河。涅尔格谢河由雨雪补给，秋季封冻，直至春季仍为冰层覆盖。河水最终经阿德恰河与亚纳河抵达拉普捷夫海。