纳奥科坎湖区位于米斯塔西尼湖东北方,靠近奥蒂什山地北部。湖中许多岛屿露出水面,来自冰川消退后部分被淹没的大量堆积物。湖水流入尼希昆湖,汇入大河上游;南方则是伊斯特梅恩河的源头。两条河各自穿过北方内陆,最终都流入詹姆斯湾。