莫桑比克海峡将马达加斯加与非洲东南海岸隔开。温暖水域中有大型涡旋和变化的海流，而非一条稳定不变的水道。西方是莫桑比克低平海岸与三角洲，东方是马达加斯加海岸。水手横穿或沿海峡航行，把非洲港口与岛屿及更远市场纳入印度洋航路。