马尔萨河穿过勒拿高原,从左岸注入勒拿河。河口处,这条支流汇入西伯利亚大河之一,后者继续向东北流经雅库特中部。马尔萨河在森林高原中绵延数百公里,与维柳伊河流域中更大的同名河流不同。它的河谷和勒拿河一起,将周围林地与更广阔的水系联系起来。