马拉帕宁河穿过亚马孙河口以东低平而森林茂密的海岸，注入大西洋。潮汐水域和红树林构成帕拉曲折海岸的一部分。十七世纪末，耶稣会士在河畔建立博因滕图传教庄园，这是沿岸数座传教庄园之一。马拉帕宁聚落在这一河流地区发展起来。