科夫多泽罗湖位于北方湖区的科夫达河水系中，河水最终流入白海。水系始于托波泽罗湖一带，穿过一系列湖泊和水道后抵达科夫多泽罗。湖岸和岛屿坐落在岩石与森林之间，较小的湖泊与湖湾相连。天然湖泊是卡累利阿内陆通往海岸这条水路上较大的水域之一。