库恰基位于乔纳河与纽亚河水系之间的森林高地。一条同名河流见于库恰基河与瓦尔纳亚河的分水地带，处在乔纳河以西。乔纳河穿过中西伯利亚高原，流向维柳伊河与勒拿河。落叶松林和漫长冬季的冰封是这一地区的特色，支流河谷切开广阔高原。