库阿穆特河汇集婆罗洲北部内陆森林地带的水流，注入京那巴当岸河。其支流包括从马廖盆地流下的水，盆地四周环绕陡坡，高处覆盖着森林。从这些高地出发，水系蜿蜒流向广阔的京那巴当岸泛滥平原和苏禄海，将山地森林与下游湿地连接起来。