孔库杰拉河穿过北贝加尔高地，流向维季姆河支流马马河。山间溪流在林木覆盖的河谷汇合，小孔库杰拉河也在大河抵达马马河之前注入其中。山脊将这一流域与南方的上安加拉河隔开。这些河流属于浩大的水网，最终经维季姆河和勒拿河流向北冰洋。