卡图吉诺位于斯塔诺夫高地的卡拉尔河流域，靠近卡图金河口。卡拉尔河蜿蜒穿过一连串山谷，汇入勒拿河的重要支流维季姆河。沿岸分布着森林山坡与岩石河岸，卡图金河则从周围高地带来水流。这些水道把贝加尔湖以北的偏远内陆与流向北冰洋的大河连接起来。