上巴打斯是婆罗洲北部巴打斯河的源流地带。山脊与森林河谷中汇集的溪流注入巴打斯河，继而穿越内陆，流向南海。上游流域靠近岛上重要的分水岭，河流从高地分向不同方向。巴打斯河穿过深峡谷，最终抵达博福特附近的沿海低地。