墨西哥湾南部水域位于尤卡坦陆架与坎佩切湾以北。沿岸低平的石灰岩地面与浅水相接，离岸更远处的开阔海盆逐渐变深。温暖的加勒比海水从尤卡坦与古巴之间进入墨西哥湾，汇入广阔海域的循环水流。海岸向西南弯向坎佩切与韦拉克鲁斯，港口面向这片海域。