冈底斯及相邻山脉高耸在西藏南部雅鲁藏布江大河谷之上。江水从北面的高地与南面的喜马拉雅山之间向东流过藏地，支流谷地通向城镇和寺院，山脊之上则更为寒冷、居民稀少。雅鲁藏布江最终在喜马拉雅山东端转向南流，成为布拉马普特拉河。