婆罗科努山脉从北天山向西延伸，将伊犁河谷与准噶尔盆地隔开。高山汇集雨雪，滋养两侧的河流：北坡水流汇入艾比湖和玛纳斯湖的内流盆地，南坡水流则进入伊犁河水系。长长的山岭构成邻近地区草场与河谷之间的天然屏障。