巴彦察干位于蒙古东部广阔草原，处在克鲁伦河谷以南。这里是连绵平原的一部分，蒙古原羚在牧草地上迁徙。北面的克鲁伦河向东流往呼伦湖，河谷中留有内亚历史不同时期使用的城垣聚落遗址。河流与南方较干旱的平原之间，以低丘和草地为主。