巴塔迈位于勒拿河与阿尔丹河汇合处的下游，两条东西伯利亚大河在此相遇。勒拿河进入雅库特中部低地，在宽阔河谷中分出水道与岛屿。巴塔迈河、图马拉河等河流从上扬斯克山地南下，注入较大的水系。森林与泛滥平原植被环绕河岸，水路连接着内陆和北极地区。