巴穆河从博萨维山以南流出，穿过巴布亚低地的沼泽森林，注入巴布亚湾。河流接纳瓦沃伊河和阿拉米亚河等支流，在河口附近拓宽为受潮汐影响的河口湾。沿河通行的巴穆语又称巴穆基瓦伊语，是一种巴布亚语言，包含上巴穆和下巴穆等方言。