巴丹吉林沙漠的沙海铺展在阿拉善高原上。巨大而相对稳定的沙山和沙丘间洼地中的湖泊，是这片荒漠最醒目的景观。最高的沙山比周围地面高约460米；许多湖泊含盐，颜色各异。风吹动松散沙粒时，沙漠的某些地段还会发出鸣响。