阿加亚坎河从孙塔尔—海亚塔山脉流入奥伊米亚康高地的阿加亚坎洼地。它与孙塔尔河汇合，形成因迪吉尔卡河的支流丘恩捷河。这些源流处于西伯利亚东北部最寒冷地区之一，四周是森林和山谷。河水穿过山地向北流去，最终抵达北极海洋。